Действие происходит в мире, населенном ниндзя. Ниндзя живут в деревнях, которые являются военной силой стран. Большинство стран имеет свою собственную Скрытую Деревню, которая служит, чтобы обучать и управлять ниндзя страны. Ниндзя могут использовать различные техники, наподобие управления предметами, превращения, создание огня, наложение иллюзий и многие другие. Главный персонаж серии – Узумаки Наруто (Uzumaki Naruto), маленький мальчик, который мечтает стать лидером (Хокаге) в своей Скрытой Деревне. При рождении в нем был запечатан демон, который угрожал уничтожением всей деревни. И хотя Наруто был всего лишь контейнером для демона, люди видели в нем только демона, что отразилось на отношении к нему. Наруто предстоит пройти много испытаний чтобы добиться уважения.